Als zeehavenstad is Harlingen bij uitstek geschikt voor watersportactiviteiten. Niet voor alleen voor het verblijf van watersporters op (door)reis, maar ook voor tal van andere activiteiten. Vanaf het Harlinger strand komen de kitesurfers in actie. De stad telt ook verschillende roeisloepen, die regelmatig door de grachten en op de Waddenzee varen. Natuurlijk zijn er ook de vaarbewegingen van de Bruine Vloot.

Daarnaast is Harlingen met regelmaat start- of finishhaven van roei- en zeilwedstrijden, zoals de Harlingen Terschelling-roeirace, de HT-zeilrace, Slag in de Rondte enzovoort